Detección del SARS-CoV-2
(COVID-19)
Desde el inicio de la pandemia por COVID-19, la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) ha sido una herramienta esencial para la detección temprana y el control del virus SARS-CoV-2.
Tipo de muestra biológica: Se utilizan comúnmente muestras respiratorias, ya que es en las vías respiratorias donde se replica el virus. Las más frecuentes: hisopado nasofaríngeo e hisopado orofaríngeo
Extracción del ácido nucleico: Se extrae el ARN viral mediante columnas de sílice, perlas magnéticas o métodos simplificados por calentamiento (95 °C).
Tipo de PCR: Se emplea generalmente RT-qPCR (PCR en tiempo real con transcripción
inversa).
1.
Retrotranscripción: el ARN viral se
convierte en ADN complementario (ADNc) mediante una transcriptasa inversa.
2.
Amplificación en tiempo real: se
amplifican regiones específicas del genoma viral utilizando cebadores y sondas
fluorescentes.
Genes amplificados:
Gen E: codifica la envoltura del virus (parte externa).
Gen N: codifica la nucleocápside, proteína que envuelve el material genético del
virus.
Gen RdRp: codifica la ARN polimerasa dependiente de ARN, enzima que el virus usa para
copiar su material genético.
Tipos de resultado:
Cualitativos:
Positivo: si se detecta ARN viral (hay curva de amplificación).
Negativo: si no se detecta ARN viral (no hay curva).
Cuantitativos:
La RT-qPCR permite estimar cuánta cantidad de ARN viral había en la muestra. Midiendo
el valor de umbral de ciclo (Ct)
Un Ct bajo (< 25) = alta carga viral
Un Ct alto (> 25) = moderada o baja carga viral
Referencia Bibliográfica:
- Yoo HM, Kim IH, Kim S. Nucleic Acid Testing of SARS‑CoV‑2. Int J Mol Sci. 2021 Jun 7;22(11):6150. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8201071/
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